При этом каждый вложенный рубль в развитие ФТС в 2008 году дал отдачу в 73,4 рубля. Всего государство потратило в 2008 году на содержание таможни 63,26 миллиарда рублей.
Таможенные сборы, наряду с налоговыми, составляют большую часть российского бюджета. По итогам 2008 года ФТС перечислила в бюджет страны рекордные 4,7 триллиона рублей. При этом за период январь-апрель 2009 года отчисления ФТС упали на 36,5 процента до 872,56 миллиарда рублей по сравнению с аналогичным периодом прошлого года. В мае сборы ФТС упали на 46 процентов.